Bioclipse es un programa gratuito de código abierto, muy conveniente para profesores e investigadores científicos, que tiene como objetivo permitir al usuario la edición especializada de proteínas y moléculas en cadenas. El programa, gracias a Internet, está conectado contínuamente con bases de datos actualizadas desde donde descargar todo tipo de información sobre moléculas, secuencias, proteínas, espectros, etc.
Entre las características principales de Bioclipse se puede citar que importa y exporta a diferentes formatos, edita estructuras moleculares en 2D, edita y visualiza secuencias (DNA, RNA, proteínas, etc), realiza gráficos de diversos tipos de espectros, visualiza propiedades de compuestos químicos, se conecta a programas externos como PyMol, etc.
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